Nuevas variantes del metapneumovirus humano post-Covid en España destacan evolución e impacto

El metapneumovirus humano (HMPV) es el principal agente etiológico de la infección del tracto respiratorio superior (URTI) y la infección del tracto respiratorio inferior (LRTI) en adultos y niños.. Un reciente Revista de enfermedades infecciosas El estudio examina la diversidad genética, la distribución y la dinámica evolutiva de HMPV.

Investigación: Aparición, impacto y evolución de las variantes del metapneumovirus humano en España desde 2014 hasta 2021. Haber de imagen: VO IMÁGENES/Shutterstock.com

Fondo

Propiedad de HMPV Pneumoviridae Familiar y causa síntomas similares al virus sincitial respiratorio humano (HRSV). El HMPV es un virus de ácido ribonucleico (ARN) de sentido negativo, lineal, con envoltura y monocatenario que se puede clasificar en los genotipos HMPV-A y HMPV-B, A1, A2 (con sus subtipos que incluyen las secuencias A2a, A2b y A2c ), B1 y B2 (linajes B2a y B2b).

El genoma de HMPV contiene ocho genes que codifican nueve proteínas. Proteínas codificadas por la secuencia 3′-NPMF-M2(M2–1/M2–2)-SH-GL-5′.

Recientemente, las duplicaciones de 180 y 111 nucleótidos en el ectodominio de la glucoproteína de unión (G) se han asociado con LRTI y evasión inmunitaria en la edad adulta.

Sobre el estudio

El presente estudio tiene como objetivo caracterizar la dinámica evolutiva y la diversidad genética del HMPV en pacientes adultos y pediátricos de un hospital universitario de Barcelona durante las temporadas 2014-2015 y 2020-2021.

Los HMPV confirmados por laboratorio se clasificaron según las secuencias del gen G de codificación parcial. Para la compilación de secuencias de nucleótidos, se utilizó MEGA.v6.0.

Los árboles filogenéticos se construyeron con base en el criterio de información bayesiano más bajo. Estos árboles fueron evaluados con 1000 remuestreos de arranque. La secuenciación del genoma completo (WGS) se realizó con Illumina y el análisis evolutivo se realizó con NextStrain y DataMonkey.

Resultados clave

De acuerdo con otros estudios, la prevalencia de HMPV en los años previos a la epidemia tuvo un patrón estacional anual y un pico claro. Sin embargo, la pandemia de la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19) interrumpió la circulación de HMPV. Desde el verano de 2020 circulan virus congelados; Sin embargo, no predominaron ni HRSV ni HMPV.

Para el verano de 2021, HMPV y HRSV estaban circulando nuevamente, causando dos picos epidémicos, el segundo comenzando en el otoño. Esto podría deberse a la falta de interferencia del virus en ese momento o a que la población española relaja sus medidas de confinamiento. Durante el segundo pico, la prevalencia de HMPV fue mayor en comparación con temporadas anteriores, posiblemente porque dos generaciones aún no habían experimentado la infección primaria.

Los co-diagnósticos más comunes son adenovirus, rinovirus, bocavirus y enterovirus. Las tasas de codiagnóstico aumentaron después de la pandemia de Covid-19 y se observó un cambio en los virus comunes codiagnosticados.

El HMPV mostró una alta incidencia entre los niños menores de dos años en temporadas preepidémicas; Sin embargo, esto cambió durante la pandemia. Los bebés varones tenían más probabilidades de verse afectados. Por el contrario, entre los adultos, las mujeres y las personas de 50 años o más tienen más probabilidades de verse afectados.

Se observó un patrón de cambios de ciclo dominante con respecto al ciclo de HMPV-A. Además, la prevalencia de virus A2c portadores de copias se observó con A2c_{180 tubo} Descrito primero, seguido de A2c_111dup. Dominio de A2c_111dup Una copia de 180 nucleótidos cubre la mayor parte de la proteína F, lo que puede afectar la fusión de membranas e inhibir la replicación viral.

De acuerdo con la prevalencia y el predominio de las variantes A2c durante la pandemia de Covid-19, se describió un aumento en la morbilidad de las infecciones por HMPV al final de la pandemia de influenza A(H1N1)pdm09 de 2009. Durante este tiempo, A2c exhibió una distancia genética promedio alta y propiedades de evasión inmune, lo que contribuyó a su dominio invasivo.

Conclusión

El HMPV afectó tanto a niños como a adultos y mostró una morbilidad significativa durante todo el período de estudio. La epidemia de HMPV se vio interrumpida por la pandemia de Covid-19 en 2020, lo que llevó a dos picos inesperados en el verano y el otoño de 2021.

WGS mostró una alta conservación de la proteína F y una rica diversidad en la proteína G, lo que indica la necesidad de un blindaje estérico en F sobre G. El presente estudio es un excelente ejemplo de vigilancia virológica de un virus respiratorio no HRSV o influenza. Esto proporciona información importante sobre la evolución en tiempo real de HMPV y su impacto en la salud pública.